Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms