Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms