Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms