Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms