Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LNPKQ9C0E8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms