Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4CQ9C0C4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4CQ9C0C4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms