Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms