Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIFKQ9BYG3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms