Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms