Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms