Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MCMBPQ9BTE3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms