Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms