Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms