Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms