Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC7Q96M83 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms