Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms