Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms