Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RNF183Q96D59 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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RNF183Q96D59 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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