Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms