Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2A3Q93084 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms