Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERCC4Q92889 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC4Q92889 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms