Protein–RNA interactions for Protein: Q92871

PMM1, Phosphomannomutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMM1Q92871 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMM1Q92871 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms