Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD1Q8TEB9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD1Q8TEB9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms