Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf43Q8TAL5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf43Q8TAL5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms