Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NEDD1Q8NHV4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NEDD1Q8NHV4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NEDD1Q8NHV4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD1Q8NHV4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms