Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL22A1Q8NFW1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL22A1Q8NFW1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms