Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms