Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms