Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms