Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms