Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYT9Q86SS6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms