Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms