Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms