Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms