Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FRMD7Q6ZUT3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms