Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC129Q6ZRS4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms