Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms