Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSBN1Q5VWQ0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSBN1Q5VWQ0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms