Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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GFI1BQ5VTD9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GFI1BQ5VTD9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GFI1BQ5VTD9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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