Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM164Q5U3C3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM164Q5U3C3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms