Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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