Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms