Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms