Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW2

NHSL2, NHS-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL2Q5HYW2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHSL2Q5HYW2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms