Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC92Q53HC0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms