Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms