Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC1Q4VXA5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms