Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFNL1Q499Z3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms