Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
QSER1Q2KHR3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms