Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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